La chiesa di San Sisto si trova, in una traversa della centralissima via Torino, nei pressi del Carrobbio, nel cuore della Milano romana.

È un luogo di culto molto antico. Secondo la tradizione, è fondato alla fine del IX secolo, durante il regno dell'ultimo re longobardo Desiderio.

L'aspetto attuale è frutto di un restauro di inizio Seicento, probabilmente promosso dall'arcivescovo Federico Borromeo. La chiesa conserva infatti ancora la facciata seicentesca a doppio ordine e l'impianto ad aula unica con cappelle laterali.

Nel corso dei secoli ha vissuto vicende travagliate e subito danneggiamenti, come il bombardamento che, nel 1943, distrusse l'abside: è oggi sostituita dal finestrone che si apre nella parete di fondo dell'edificio.

Nel 1969 il Comune di Milano concede San Sisto in comodato a Francesco Messina, all'epoca prossimo alla pensione dall'insegnamento all'Accademia di Brera e alla ricerca di un nuovo spazio in cui continuare il suo lavoro. Messina fa restaurare a proprie spese la chiesa - da tempo sconsacrata - salvandola dalla demolizione, e la trasforma nel suo studio museo.